Кирилл Борисович Назаренко родился 21 июля 1976 г. в г. Выборге Ленинградской обл.
Окончил в 1993 г. школу-гимназию №67 с углублённым изучением испанского языка.
В 1998 г. окончил Исторический факультет Санкт-Петербургского государственного университет (специализировался по кафедре Русской истории). В 2001 г. защитил кандидатскую диссертацию по теме: «Морское министерство России в 1905-1914 гг.» Диплом и кандидатская диссертация написаны под руководством д.и.н., проф. М.Ф. Флоринского. В 2010 г. защитил докторскую диссертацию по теме «Морское ведомство России в 1905-1921 гг.: Личный состав, структура, политическая роль». С 2002 г. работает на Историческом факультете (ныне — Институте истории) СПбГУ ассистентом, старшим преподавателем, доцентом, профессором (с 2014 г.) кафедры источниковедения истории России.
Опубликовал более 100 научных работ, в том числе 10 монографий.
Постоянный спикер Цифровой истории.